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生物芯片技术
课程类型：
选修课
主讲教师：
建议学分：
0.00分
课程编码：
mk003014
课程介绍
课程目录
教师团队
{1}--第一章概述
s
[1.1]--1.1生物芯片技术产生的历史背景4.11
（8分钟）
s
[1.2]--1.2生物芯片技术类型4.11
（10分钟）
s
[1.3]--1.3生物芯片在遗传性疾病诊断中
（9分钟）
s
[1.4]--1.5生物芯片在生命科学研究领域
（9分钟）
s
[1.5.1]--样片（定稿）
（15分钟）
s
[1.5.2]--实验1R语言及其运行简介
（34分钟）
{2}--第二章基因芯片的制备
s
[2.1]--2.1基因芯片的设计4.11
（6分钟）
s
[2.2]--2.2基因芯片探针的制备
（9分钟）
s
[2.3]--2.3基片的选择与表面处理4.6
（7分钟）
s
[2.4]--2.4点样及点样后处理
（6分钟）
s
[2.5.1]--实验二R基本语法及使用
（15分钟）
s
[2.5.2]--实验2数据文件的建立、导入及调用
（23分钟）
s
[2.6]--实验3ALL数据包下载及调用分析(1)
（28分钟）
{3}--第三章表达谱基因芯片的实验过程
s
[3.1]--3.1基因芯片表达实验设计
（9分钟）
s
[3.2]--3.2样本标记与芯片杂交4.6
（9分钟）
s
[3.3]--3.3芯片扫描与图像分析4.11
（9分钟）
s
[3.4]--实验三：ALL数据包下载及调用分析
（10分钟）
s
[3.5]--实验3ALL数据包下载及调用分析
（28分钟）
{4}--第四章芯片数据预处理与归一化
s
[4.1]--4.1芯片表达数据的统计性描述与评价4.21
（8分钟）
s
[4.2]--4.2芯片数据的系统变异与标准化4.11
（10分钟）
s
[4.3]--实验四：ALL数据集表型数据分析及可视化
（7分钟）
s
[4.4]--实验5芯片质量分析与可视化
（9分钟）
s
[4.5.1]--5.1基因芯片数据的质量控制（ALL数据包为例）
（38分钟）
s
[4.5.2]--5.2基因芯片数据的预处理（ALL数据为例）
（18分钟）
{5}--第五章差异表达基因分析
s
[5.1]--5.1
（10分钟）
s
[5.2]--实验6芯片数据的预处理与标准化
（14分钟）
s
[5.3]--实验7差异表达基因筛选1
（10分钟）
s
[5.4]--实验8差异表达基因筛选2
（13分钟）
s
[5.5]--第9课生存分析
（12分钟）
s
[5.6]--6差异表达基因的筛选（T检验与SAMR分析）
（22分钟）
{6}--第六章基因芯片聚类分析与可视化
s
[6.1]--6.1聚类分析
（13分钟）
s
[6.2]--实验9聚类分析
（10分钟）
s
[6.3]--7聚类分析（ALL数据为例）
（25分钟）
{7}--第七章基因芯片信号通路及注释分析
s
[7.1]--7.1基因注释与信号通路分析_1
（11分钟）
s
[7.2]--KEGG数据库
（11分钟）
s
[7.3]--GO数据库
（12分钟）
s
[7.4]--基因功能富集分析
（11分钟）
s
[7.5]--公共数据库中
（14分钟）
s
[7.6]--7.2数据标准化与递交
（9分钟）
s
[7.7.1]--8.1KEGG分析
（25分钟）
s
[7.7.2]--8.2GOexpress分析
（25分钟）
